Kako se računa rezultat poravnanja?
Kako se računa rezultat poravnanja?

Video: Kako se računa rezultat poravnanja?

Video: Kako se računa rezultat poravnanja?
Video: Как самой вылечить недержание мочи? Эти упражнения поднимут органы на место! 2024, Novembar
Anonim

The rezultat od an poravnanje , S, izračunati kao zbir zamjene i jaza rezultati . Zamjena rezultati date su preglednom tabelom (vidi PAM, BLOSUM). Gap rezultati su tipično izračunati kao zbir G, kazne za otvaranje praznine i L, kazne za produženje praznine. Za jaz dužine n, trošak jaza bi bio G+Ln.

Shodno tome, šta je rezultat poravnanja?

Optimalno poravnanje i rezultat poravnanja Optimalno poravnanje je poravnanje dajući najviše rezultat , i rezultat poravnanja je ovo najviše rezultat . Odnosno rezultat poravnanja od X i Y = the rezultat od X i Y pod optimalnim poravnanje . Na primjer, the rezultat poravnanja od sljedećih X i Y je 36.

Osim gore navedenog, kako funkcionira poravnanje sekvenci? U bioinformatici, a poravnanje sekvence je način uređenja sekvence DNK, RNK ili proteina za identifikaciju regija sličnosti koje mogu biti posljedica funkcionalnih, strukturnih ili evolucijskih odnosa između sekvence.

Što je skor u bioinformatici?

U kontekstu poravnanja sekvenci, a rezultat je numerička vrijednost koja opisuje ukupni kvalitet poravnanja. Veći brojevi odgovaraju većoj sličnosti. The rezultat skala zavisi od bodovanje korišteni sistem (matrica zamjene, kazna gapa).

Šta je optimalno poravnanje kod poravnanja sekvenci?

The optimalno poravnanje od dva proteina sekvence je poravnanje koji maksimizira zbir rezultata u paru umanjen za svaku kaznu za uvedene praznine. Dinamičko programiranje omogućava optimalno poravnanje od dva sekvence nalazi se u redoslijedu mnskoraka, gdje su m i n dužine sekvence.

Preporučuje se: